ارائه دهنده داده ها:

DOAJ یک دایرکتوری آنلاین با اجتماع است که فهرست ها را به مجلات با کیفیت بالا ، دسترسی آزاد ، همسالان ارائه می دهد.

فعال (ارائه دهنده داده ها در آخرین سال تقویم ابرداده ارسال شده است)

مقاله خبرنگاری

محدودیت گونه ها ، روابط فیلوژنتیک و مدل واگرایی موقتی در جنس Aeromonas [2018]

J. G. Lorén ؛ماریبل فارفان ؛ماریبل فارفان ؛M. C. Fusté ؛و همکاران

به متن کامل دسترسی پیدا کنید

محدودیت گونه ها ، روابط فیلوژنتیک و مدل واگرایی موقتی در جنس Aeromonas

2018 J. G. Lorén ؛ماریبل فارفان ؛ماریبل فارفان ؛M. C. Fusté ؛M. C. Fusté https://doaj. org/article/d5de20cbc9c94f54b3698398060eaada

تعریف مرزهای گونه ها یک چالش مهم در مطالعات تنوع زیستی است. در این کار ما از روش متناوب یول مخلوط شده (GMYC) استفاده کردیم ، که آستانه واگرایی را برای محدود کردن گونه ها در یک درخت فیلوژنتیک تعیین می کند. بر اساس الگوی انشعاب درخت ، تجزیه و تحلیل آستانه انتقال بین زایمان و فرآیند انسجام مرتبط با تنوع داخل گونه ها را برطرف می کند. این روش به طور گسترده ای برای ترسیم گونه های یوکاریوت و ایجاد فرآیند تنوع آنها از داده های توالی استفاده شده است. با این وجود ، نمونه های اندکی وجود دارد که در آن این تجزیه و تحلیل برای جمعیت باکتریایی اعمال شده است. اگرچه روش GMYC در ابتدا برای فرض یک مدل ثابت (YUL) از تنوع در سطح بین گونه ها طراحی شده است ، اما بعداً شبیه سازی شرایط دیگر ارزیابی شد. بنابراین هدف ما تعیین مشخصات گونه در آئرومونا با استفاده از روش GMYC و الاغ هایی بود که مدل بهترین فرآیند زایمان را در این جنس باکتریایی توضیح می دهد. استفاده از روش GMYC به ما این امکان را می دهد تا مرزهای گونه های Aeromonas را به وضوح ، حتی در گروه های بحث برانگیز ، مانند مجتمع های A. veronii یا A. رسانه ها ، به وضوح ترسیم کنیم.

2022/DJ/DJ2022_0. RDF

تعریف مرزهای گونه ها یک چالش مهم در مطالعات تنوع زیستی است. در این کار ما از روش متناوب یول مخلوط شده (GMYC) استفاده کردیم ، که آستانه واگرایی را برای محدود کردن گونه ها در یک درخت فیلوژنتیک تعیین می کند. بر اساس الگوی انشعاب درخت ، تجزیه و تحلیل آستانه انتقال بین زایمان و فرآیند انسجام مرتبط با تنوع داخل گونه ها را برطرف می کند. این روش به طور گسترده ای برای ترسیم گونه های یوکاریوت و ایجاد فرآیند تنوع آنها از داده های توالی استفاده شده است. با این وجود ، نمونه های اندکی وجود دارد که در آن این تجزیه و تحلیل برای جمعیت باکتریایی اعمال شده است. اگرچه روش GMYC در ابتدا برای فرض یک مدل ثابت (YUL) از تنوع در سطح بین گونه ها طراحی شده است ، اما بعداً شبیه سازی شرایط دیگر ارزیابی شد. بنابراین هدف ما تعیین مشخصات گونه در آئرومونا با استفاده از روش GMYC و الاغ هایی بود که مدل بهترین فرآیند زایمان را در این جنس باکتریایی توضیح می دهد. استفاده از روش GMYC به ما این امکان را می دهد تا مرزهای گونه های Aeromonas را به وضوح ، حتی در گروه های بحث برانگیز ، مانند مجتمع های A. veronii یا A. رسانه ها ، به وضوح ترسیم کنیم.